智汇工业-智慧工业、智能制造及工业智能、工业互联门户网站,专业的工业“互联网+”传媒

FPGA大顯身手 基因組測序時間從30小時縮短到26分鐘

來源:網絡

點擊:934

A+ A-

所屬頻道:新聞中心

關鍵詞: FPGA,基因組測序

    目前,FPGA在實時基因組測序計算大顯身手,把測序時間從30小時縮短到26分鐘,之后基因組測序計算時間將會縮短到10分鐘,預計一個全序列基因編譯可以在接近實時的時間內完成。

    基因組測序是一種新型基因檢測技術,它可以從血液或者唾液中分析測定基因全序列,用來預測疾病,個人的行為特征等等。實現這一項技術需要海量的計算支持,常常需要等待一段時間才可以獲得檢測結果。然而,Edico Genome推出的“龍”硬件加速卡將測序計算時間由30小時縮短到26分鐘,很快就可能優化實現實時計算的目標。

    IBM Power Systems最近發表了題為“Powerful computing crunches genomic data at warp speed”的文章,文章描述了Edico Genome使用硬件加速器來加速基因研究的海量計算。Edico Genome董事長兼CEO Pieter van Rooyen和他的團隊在南非進行血液分析的工作,主要面向兩種疾?。喊滩?HIV)和肺結核(tuberculosis)。同時他們也開發了一款定制的硬件加速卡來加速計算,這款加速卡就是“龍”卡,卡上集成了基于IBM Power8處理器的S822LC高性能計算服務器和Xilinx 28nm FPGA。

    加速卡計算的效果如何呢?“之前一個基因組測序需要大約30小時” van Rooyen說,“我們已經把計算時間降到26分鐘,很快,我們就會進一步優化到10分鐘”。他預計一個全序列基因編譯可以在接近實時的時間內完成。

    Stone在視頻中解釋說,FPGA加速卡將處理時間縮減到6分鐘左右,而純軟件處理大概需要6小時,FPGA硬件加速提供了約50X~60X的加速性能。目前Edico Genome“龍”卡上用的是Xilinx 28nm器件,公司已經考慮在他們下一代的板子上使用Xilinx UltraScale器件,在現有基礎上再獲得5X的加速性能提升。

    (審核編輯: 林靜)

    聲明:除特別說明之外,新聞內容及圖片均來自網絡及各大主流媒體。版權歸原作者所有。如認為內容侵權,請聯系我們刪除。

    主站蜘蛛池模板: 三机一体除湿干燥机,色母机,称重式拌料机,工业冻水机,中央集中供料-东莞市瑞达机械科技有限公司(瑞达国际) | 轴流消防排烟风机,排烟防火阀厂家,铝合金百叶风口-德州正邦通风设备有限公司 | 思达测试|山东思达高科机械设备有限公司 | 中婴网,推动母婴产业健康·可持续发展,婴童网络专业传媒,母婴网,360孕婴童网,婴童品牌,婴儿用品品牌,婴儿用品加盟店,母婴用品加盟店 | 久久91精品久久91综合_国产亚洲自拍一区_国产精品第1页_亚洲高清视频一区_91成人午夜在线精品_亚洲国产精品网站在线播放_亚洲国产成人久久综合区_国产精品亚洲专区在线观看_免费视频精品一区二区三区 | 园林绿化平台|园林绿化网|苗木网|苗圃网||苗木报价网|园林招标网|园林苗木网|园林工程网|景观设计网|园林机械网|绿化苗木网| | 上海喷涂厂|上海喷漆厂|粉末喷涂|平湖喷涂厂|平湖喷漆厂-平湖华梦金属科技有限公司 | 耐磨复合钢板_堆焊复合钢板_堆焊耐磨钢板-北京耐默公司 | 英格索兰隔膜泵_ARO气动隔膜泵_英格索兰隔膜泵配件【原厂正品】连续五年无投诉_英格索兰隔膜泵代理-苏州瑞晟茂环保设备有限公司 印刷公司,北京印刷厂,宣传画册手册印刷厂-和智印彩页设计 | 儒亚科技_磁悬浮天平,竞争吸附,高压热重,重量法高压,高压密度 | 喷雾式干燥机-真空桨叶干燥机-桨叶干燥器-常州力马干燥科技有限公司 | 食品甲醛测定仪,啤酒甲醛测定仪,食盐碘测定仪,食品细菌检验仪,水质细菌检验仪-厦门欣锐仪器仪表有限公司 | 绣花厂_电脑绣花厂_手工刺绣加工定制 - 北京丽绣坊工艺品有限公司 | 九江江菱电梯有限公司| 检重秤,液化气充装秤,滚筒电子秤,汽车衡厂家|上海越衡实业 | 南京人才网_南京招聘网_南京人才市场最新招聘信息 | 南京叉车|电瓶叉车|电动叉车|电动堆高车|电动搬运车-南京诺嘉机械 | 数造云-面向3D打印的云制造平台 数控落地镗铣床_数控刨台式镗铣床_数控龙门加工中心-青岛辉腾机械设备有限公司 | 显微镜|金相显微镜|光学显微镜专业生产商-上海光学仪器厂 | 西安防静电地板_防静电地板厂家_防静电地板价格_OA网络地板_写字楼架空地板_机房墙板安装-红梅防静电地板厂家直销 | 西安防静电地板_防静电地板厂家_防静电地板价格_OA网络地板_写字楼架空地板_机房墙板安装-红梅防静电地板厂家直销 | 江苏广分检测技术有限公司、电力安全工具检测、苏州绝缘工具检测、昆山电力安全工具检测-广分检测技术(苏州)有限公司 | 日本进口东丽碳纤维材料-上海久扶新材料科技有限公司 | 铜陵租车_铜陵租车网_铜陵租车公司_铜陵婚车租赁_铜陵汽车租赁公司-良车汽车租赁 | 辣椒烘干机-百信机械提供大中小型辣椒烘干机房设备视频图片厂家价格多少钱 | 推拉雨棚,防雨棚,遮阳遮雨棚,伸缩雨棚,移动雨棚,电动雨棚,雨棚制作厂家 - 山东创力篷业 | 盐城市宏展环保材料有限公司-官网-滤袋,过滤袋,液体过滤袋,袋式过滤器,无纺布过滤袋,废液过滤袋 盐城市城镇化建设投资集团有限公司[盐城国资企业、盐城国资集团、盐城文化旅游、盐城基础设施、盐城土地开发、盐城粮食收储] | 妙手网-圆心大药房-广东圆心恒金堂医药连锁有限公司-放心的网上药店_妙手医生旗下正规网上买药平台 | 云南破碎机-制砂机-洗砂机-振动筛-昆明昆重机械厂家 | 互动投影_全息投影_提供一站式互动投影解决方案_水滴石科技 | 郫都人才网_郫都招聘网_求职找工作平台| 体育馆木地板厂家_篮球木地板价格_舞台木地板品牌-欧氏地板 | 皮革耐折试验机-消字率测试仪-面具全视野测试仪-东莞市誉扬检测仪器有限公司 | 山东土工膜_复合土工膜_防水板生产厂家-山东德旭达土工材料有限公司 | 仪器校准,校验,校正,检定选值得托付的第三方法定计量检测机构! 铱金供应-上海钌合金-氯铱酸厂家-上海庞势新材料科技有限公司 | 伸缩接头,限位伸缩接头,传力接头,可拆卸接头,橡胶接头,衬四氟橡胶接头,橡胶软连接,橡胶补偿器,防水套管- 巩义市隆盛管道设备有限公司 | 淄博润裕机械设备有限公司-搅拌器,搅拌桨叶,反应釜,机械密封,化工搅拌 | 青岛色粉_色母及改性塑料供应厂家 - 青岛建轩新材料有限公司 | 十树品牌策划—品牌战略、品牌策划、品牌定位、品牌设计、包装设计、品牌营销-上海十树品牌管理咨询有限公司官网 | 王者荣耀/和平精英扫码上号登录器_微信安卓苹果扫码上号登录软件 - 上号宝扫码登录器 | 饮料瓶-白酒瓶-绿色玻璃瓶-山东玻璃瓶厂家-枣庄市金泰玻璃有限公司 |